Olá, Benedito.

Segundo o Portal do MEC (portal.mec.gov.br),

São exemplos de atividades complementares: participação em eventos internos e externos à instituição de educação superior, tais como: semanas acadêmicas, congressos, seminários, palestras, conferências, atividades culturais; integralização de cursos de extensão e/ou atualização acadêmica e profissional; atividades de iniciação científica, assim como de monitoria.

Sendo assim, creio que a Khan Academy não se enquadra em nenhum desses exemplos. Além disso a KA é uma ferramenta de auxílio no processo de ensino aprendizagem que não oferece certificado para seus "cursos", o que torna ainda mais difícil formalizar os estudos feitos aqui na plataforma para compor um banco de horas complementares/suplementares.