A Khan Academy nem akkreditált iskola, és az oldalon végzett munka nem számítható be diploma vagy egyéb képesítés megszerzése során. A Khan Academyt leginkább a szokásos iskolai oktatás kiegészítéseként érdemes használni, legyen szó akár magántanulókról, akár hagyományos iskoláról.

A Khan Academyn csak a következő oklevelek érhetőek el:

• Tanárképzési oklevelek 
• LearnStorm oklevelek
• Motivációs oklevél minták

Az utóbbiakat oktatóknak szántuk. Ezeket nem a Khan Academy munkatársai állítják ki.